I en tid da kvinner hadde begrensede karrieremuligheter, gjorde Merian sitt eget yrke. På 13, oppmuntret av hennes styvfar, begynte hun å male insekter og blomster. Som en jente i Frankfurt, Tyskland, ble hun fascinert av insekter, og fant et spesielt talent for å oversette sine fysiske former til maling og papir med både kunstnerisk ferdighet og vitenskapelig nøyaktighet. Ved 28, publiserte hun sitt første volum av illustrasjoner.
En av hennes senere volumer var enda mer signifikant. Det illustrerte prosessen med metamorfose, som i 1700-tallet fremdeles var en teori. I boken avbildet Merian livscyklusene av sommerfugler og møller, sammen med deres matkilder, som bidro til å motbevise det generelt mottatte forestillingen om at insekter spontant genereres fra forfallende saken.
Etter denne publikasjonen, i mellom å skille seg fra, bodde i en kommune og flyttet til Nürnberg, begynte Amsterdam-Merian henne "lenge drømt om reisen." Ledsaget av datteren Dorothea og sponsorering fra Amsterdam (en sjelden prestasjon for en kvinne) hun avviste for hva som skulle være et femårig opphold i Surinam, deretter en nederlandsk koloni på nordkysten av Sør-Amerika. Imidlertid kom hun tilbake til Nederland etter bare to år, i en alder av 54 år, etter å ha inngått malaria.
Men over de neste fire årene produserte Merian 60 gravyr fra sin tid der. I 1705 publiserte hun seg selv Metamorphosis insectorum Surinamensium (Metamorfose av insekter av Surinam), som sementerte sin status som både en ledende entomolog og en naturartner.
Merians arbeid - både nyskapende og vakkert sløvt, glemt, i århundrer etter hennes død i 1717. Senere forskere avviste generelt sitt arbeid fordi hun var kvinne og manglet formell utdanning. Heldigvis var det 20. århundre knapt til hennes bidrag. Hun er blitt immortalized på et tysk banknotat og i en Google-doodle. Hennes livlige illustrasjoner holdes i museer rundt om i verden. Til feiring av hennes banebrytende arbeid har Berlins Kupferstichkabinett en utstilling av sitt arbeid frem til 7. juli 2017. Atlas Obscura har et utvalg av hennes detaljerte, utsmykkede arbeid.